La formation est organisée en alternance sur 12 mois ou 22 mois (pour les personnes exerçant une activité professionnelle). Elle se compose de la façon suivante :
La pédagogie est essentiellement basée sur des approches dynamiques mêlant études de cas, jeu de rôle, travaux de groupes, visites de terrain ou voyages d’études. Les enseignements sont dispensés par des enseignants des deux institutions et font appel à de nombreux experts extérieurs reconnus.
Langue d’enseignement : français (sauf exception pour quelques conférences)
Lieu : Paris
Elle se déroule dans une institution publique ou privée dans laquelle l’étudiant doit traiter un sujet prospectif en lien avec les questions santé environnement et développement durable. L’étudiant est encadré par des experts scientifiques de l’EHESP ou de MINES ParisTech pendant sa mission professionnelle et lors de la rédaction de la thèse professionnelle. Cette dernière constitue un outil de réflexion pour le partenaire d’accueil mais peut également contribuer à définir de futurs axes de recherche.
Organisation et rythme d’alternance du MS
| Type de public | Durée de la formation | Rythme de la partie académique | Durée de la mission professionnelle | Soutenance thèse professionnelle |
| Jeunes diplômés | 12 mois | 2 semaines par mois de sept. à juin | 5 mois (*) | Nov. de lannée n+1 |
| Cadres en activité | 22 mois | 1 semaine par mois de sept. à juin | 5 mois (**) | Juil. de l'année n+2 |
(*) La mission professionnelle peut, soit se dérouler en alternance à un rythme convenu avec la structure d’accueil, soit s’effectuer sur 5 mois consécutifs après la partie académique. (**) Pour les professionnels en activité, la mission professionnelle est a réaliser librement sur les 22 mois de formation.